ეპიდზედამხედველობის ინტეგრირებულ ეროვნულ სისტემაში მონაწილე ორგანოებს მიეკუთვნებიან:

ა)  სსიპ – ლ. საყვარელიძის სახელობის დაავადებათა კონტროლისა და საზოგადოებრივი ჯანმრთელობის ეროვნული ცენტრი და მისი ტერიტორიული ერთეულები;

ბ) მუნიციპალიტეტებთან არსებული საზოგადოებრივი ჯანმრთელობის ცენტრები/სამსახურები;

გ)  სსიპ − სურსათის ეროვნული სააგენტო და მისი ტერიტორიული ორგანოები;

დ) სსიპ − საქართველოს სოფლის მეურნეობის სამინისტროს ლაბორატორია და მისი ტერიტორიული ორგანოები;

ე)  სსიპ − შემოსავლების სამსახური;

ვ) საქართველოს გარემოსა და ბუნებრივი რესურსების დაცვის სამინისტრ